五十年来，研究院荟萃了我国一大批著名数学家和系统科学家。四个研究所的科研人员在理论研究和实际应用方面，为我国数学和系统科学的发展以及国民经济和国防建设做出了重要的贡献，获得各种科技奖励400余项，其中包括首届国家最高科学技术奖 ( 吴文俊)， 4项国家自然科学奖一等奖(华罗庚“典型域上的多元复变数函数论” ，吴文俊“示性类与示嵌类的研究” ，陈景润和王元等 “哥德巴赫猜想研究” ，冯康等“哈密尔顿系统的辛几何算法”)，以及十多项重要的国际学术奖励。不少重要的应用性成果受到中央领导和实际部门的充分肯定，显示了数学和系统科学理论在国民经济主战场的作用。

    研究院现有科研人员200余人， 包括中国科学院院士15人，中国工程院院士2人，国家杰出青年基金获得者27人，中科院“百人计划”入选者20人，博士生导师80人。

    中国科学院、工程院院士：吴文俊、王元、杨乐、陆启铿、万哲先、丁夏畦、石钟慈、陈翰馥、丁伟岳、林群、马志明、崔俊芝、陆汝钤、李邦河、严加安、刘源张、郭雷。

    国家杰出青年科学基金获得者：郭雷、席南华、袁亚湘、高小山、张纪峰、贾朝华、朱力行、吉敏、周向宇、冯琦、张汉勤、李嘉禹、王友德、孙笑涛、陈志明、程兵、汪寿阳、王跃飞、巩馥洲、姚鹏飞、徐飞、张立群、郭宝珠、曹道民、周爱辉、洪奕光、杨晓光。

    中国科学院"百人计划"入选者:  李嘉禹、曹道民、李洪波、袁礼、许跃生、杜强、赵开明、张汉勤、程兵、汪寿阳、郭宝珠、徐飞、陈志明、段海豹、岳澄波、葛力明、万大庆、蒋云平、贺正需、张波。